MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Mycoplasma conjunctivae HRC/581 chromosome

Total Repeats: 21197

< Previous12...31323334353637383940414243Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
21001	NC_012806	ACC	3	9	839057	839065	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	240047826
21002	NC_012806	TAT	2	6	839123	839128	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	240047826
21003	NC_012806	A	7	7	839136	839142	100 %	0 %	0 %	0 %	240047826
21004	NC_012806	T	7	7	839158	839164	0 %	100 %	0 %	0 %	240047826
21005	NC_012806	CTG	2	6	839170	839175	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240047826
21006	NC_012806	AGA	2	6	839210	839215	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240047826
21007	NC_012806	A	6	6	839215	839220	100 %	0 %	0 %	0 %	240047826
21008	NC_012806	TAA	2	6	839222	839227	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	240047826
21009	NC_012806	A	6	6	839237	839242	100 %	0 %	0 %	0 %	240047826
21010	NC_012806	A	6	6	839305	839310	100 %	0 %	0 %	0 %	240047826
21011	NC_012806	TGA	2	6	839372	839377	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240047826
21012	NC_012806	AAG	2	6	839386	839391	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240047826
21013	NC_012806	T	6	6	839403	839408	0 %	100 %	0 %	0 %	240047826
21014	NC_012806	ACAA	2	8	839419	839426	75 %	0 %	0 %	25 %	240047826
21015	NC_012806	TCA	2	6	839500	839505	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240047826
21016	NC_012806	TAT	2	6	839529	839534	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	240047826
21017	NC_012806	ACC	2	6	839580	839585	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	240047826
21018	NC_012806	TGC	2	6	839609	839614	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240047826
21019	NC_012806	A	6	6	839661	839666	100 %	0 %	0 %	0 %	240047826
21020	NC_012806	A	6	6	839685	839690	100 %	0 %	0 %	0 %	240047826
21021	NC_012806	A	7	7	839788	839794	100 %	0 %	0 %	0 %	240047826
21022	NC_012806	TAGA	2	8	839866	839873	50 %	25 %	25 %	0 %	240047826
21023	NC_012806	GAAG	2	8	839906	839913	50 %	0 %	50 %	0 %	240047826
21024	NC_012806	TCT	2	6	839918	839923	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240047826
21025	NC_012806	AGA	2	6	839930	839935	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240047826
21026	NC_012806	ATT	2	6	839940	839945	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	240047826
21027	NC_012806	TGA	2	6	839972	839977	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240047826
21028	NC_012806	AAT	2	6	839978	839983	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	240047826
21029	NC_012806	A	6	6	840021	840026	100 %	0 %	0 %	0 %	240047826
21030	NC_012806	A	7	7	840094	840100	100 %	0 %	0 %	0 %	240047826
21031	NC_012806	ATGA	2	8	840110	840117	50 %	25 %	25 %	0 %	240047826
21032	NC_012806	TGA	2	6	840153	840158	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240047826
21033	NC_012806	GAT	2	6	840186	840191	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240047826
21034	NC_012806	ATG	2	6	840241	840246	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240047826
21035	NC_012806	TTC	2	6	840263	840268	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240047826
21036	NC_012806	ATC	2	6	840363	840368	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240047826
21037	NC_012806	T	7	7	840369	840375	0 %	100 %	0 %	0 %	240047826
21038	NC_012806	TTA	2	6	840409	840414	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	240047826
21039	NC_012806	ATTA	2	8	840449	840456	50 %	50 %	0 %	0 %	240047826
21040	NC_012806	AACTC	2	10	840564	840573	40 %	20 %	0 %	40 %	240047826
21041	NC_012806	TAA	3	9	840626	840634	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	240047826
21042	NC_012806	AT	3	6	840643	840648	50 %	50 %	0 %	0 %	240047826
21043	NC_012806	AT	3	6	840653	840658	50 %	50 %	0 %	0 %	240047826
21044	NC_012806	AAGC	2	8	840685	840692	50 %	0 %	25 %	25 %	240047826
21045	NC_012806	TGA	2	6	840698	840703	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240047826
21046	NC_012806	A	7	7	840735	840741	100 %	0 %	0 %	0 %	240047826
21047	NC_012806	TAA	2	6	840743	840748	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	240047826
21048	NC_012806	AT	3	6	840749	840754	50 %	50 %	0 %	0 %	240047826
21049	NC_012806	TTTA	2	8	840798	840805	25 %	75 %	0 %	0 %	240047826
21050	NC_012806	TCA	2	6	840816	840821	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240047826
21051	NC_012806	AT	3	6	840824	840829	50 %	50 %	0 %	0 %	240047826
21052	NC_012806	TAA	2	6	840835	840840	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	240047826
21053	NC_012806	ATC	2	6	840859	840864	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240047826
21054	NC_012806	GAA	2	6	840868	840873	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240047826
21055	NC_012806	A	8	8	840878	840885	100 %	0 %	0 %	0 %	240047826
21056	NC_012806	ATT	2	6	840891	840896	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	240047826
21057	NC_012806	T	6	6	840905	840910	0 %	100 %	0 %	0 %	240047826
21058	NC_012806	T	6	6	840914	840919	0 %	100 %	0 %	0 %	240047826
21059	NC_012806	ATT	2	6	840925	840930	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	240047826
21060	NC_012806	AAG	2	6	840949	840954	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240047826
21061	NC_012806	A	8	8	840990	840997	100 %	0 %	0 %	0 %	240047826
21062	NC_012806	TGA	2	6	841010	841015	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240047826
21063	NC_012806	ATT	2	6	841017	841022	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	240047826
21064	NC_012806	TAA	2	6	841100	841105	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	240047826
21065	NC_012806	TAA	2	6	841132	841137	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	240047826
21066	NC_012806	GTT	3	9	841176	841184	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	240047826
21067	NC_012806	AAT	2	6	841191	841196	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	240047826
21068	NC_012806	TTA	2	6	841212	841217	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	240047826
21069	NC_012806	ATAAA	2	10	841222	841231	80 %	20 %	0 %	0 %	240047826
21070	NC_012806	A	6	6	841246	841251	100 %	0 %	0 %	0 %	240047826
21071	NC_012806	AAT	2	6	841254	841259	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	240047826
21072	NC_012806	ATT	2	6	841263	841268	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	240047826
21073	NC_012806	A	7	7	841274	841280	100 %	0 %	0 %	0 %	240047826
21074	NC_012806	A	6	6	841297	841302	100 %	0 %	0 %	0 %	240047826
21075	NC_012806	TAT	2	6	841303	841308	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	240047826
21076	NC_012806	TAAA	2	8	841324	841331	75 %	25 %	0 %	0 %	240047826
21077	NC_012806	GAA	4	12	841350	841361	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240047826
21078	NC_012806	AAATT	2	10	841386	841395	60 %	40 %	0 %	0 %	240047826
21079	NC_012806	A	7	7	841404	841410	100 %	0 %	0 %	0 %	240047826
21080	NC_012806	TAATT	2	10	841413	841422	40 %	60 %	0 %	0 %	240047826
21081	NC_012806	T	7	7	841477	841483	0 %	100 %	0 %	0 %	240047827
21082	NC_012806	T	7	7	841504	841510	0 %	100 %	0 %	0 %	240047827
21083	NC_012806	GAA	2	6	841547	841552	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240047827
21084	NC_012806	ATC	2	6	841581	841586	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240047827
21085	NC_012806	AATA	2	8	841604	841611	75 %	25 %	0 %	0 %	240047827
21086	NC_012806	TTA	2	6	841656	841661	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	240047827
21087	NC_012806	TAA	2	6	841712	841717	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	240047827
21088	NC_012806	T	6	6	841781	841786	0 %	100 %	0 %	0 %	240047827
21089	NC_012806	CTT	2	6	841834	841839	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240047827
21090	NC_012806	T	6	6	841858	841863	0 %	100 %	0 %	0 %	240047827
21091	NC_012806	ATA	2	6	841889	841894	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	240047827
21092	NC_012806	TTG	2	6	841910	841915	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	240047827
21093	NC_012806	T	7	7	841932	841938	0 %	100 %	0 %	0 %	240047827
21094	NC_012806	GAA	2	6	841950	841955	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240047827
21095	NC_012806	AC	3	6	841959	841964	50 %	0 %	0 %	50 %	240047827
21096	NC_012806	CTT	2	6	841972	841977	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240047827
21097	NC_012806	T	6	6	841976	841981	0 %	100 %	0 %	0 %	240047827
21098	NC_012806	ATG	2	6	841992	841997	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240047827
21099	NC_012806	T	6	6	842009	842014	0 %	100 %	0 %	0 %	240047827
21100	NC_012806	AAT	2	6	842024	842029	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	240047827
21101	NC_012806	T	7	7	842120	842126	0 %	100 %	0 %	0 %	240047827
21102	NC_012806	TCA	2	6	842157	842162	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240047827
21103	NC_012806	T	6	6	842165	842170	0 %	100 %	0 %	0 %	240047827
21104	NC_012806	GGT	2	6	842257	842262	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	240047827
21105	NC_012806	TTGCT	2	10	842279	842288	0 %	60 %	20 %	20 %	240047827
21106	NC_012806	TCA	2	6	842304	842309	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240047827
21107	NC_012806	CAAA	2	8	842413	842420	75 %	0 %	0 %	25 %	240047827
21108	NC_012806	AATA	2	8	842452	842459	75 %	25 %	0 %	0 %	240047827
21109	NC_012806	TA	3	6	842523	842528	50 %	50 %	0 %	0 %	240047827
21110	NC_012806	GGAT	2	8	842567	842574	25 %	25 %	50 %	0 %	240047827
21111	NC_012806	ATA	2	6	842638	842643	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	240047827
21112	NC_012806	TTC	2	6	842705	842710	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240047827
21113	NC_012806	T	6	6	842762	842767	0 %	100 %	0 %	0 %	240047827
21114	NC_012806	ATT	2	6	842778	842783	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	240047827
21115	NC_012806	T	6	6	842828	842833	0 %	100 %	0 %	0 %	240047827
21116	NC_012806	GAA	2	6	842865	842870	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240047827
21117	NC_012806	GATT	2	8	842915	842922	25 %	50 %	25 %	0 %	240047827
21118	NC_012806	CTA	2	6	842992	842997	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240047827
21119	NC_012806	ATTTTT	2	12	843008	843019	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	240047827
21120	NC_012806	TAA	2	6	843026	843031	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	240047827
21121	NC_012806	TTAGAT	2	12	843048	843059	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	240047827
21122	NC_012806	AT	3	6	843075	843080	50 %	50 %	0 %	0 %	240047827
21123	NC_012806	AAT	2	6	843102	843107	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	240047827
21124	NC_012806	TAT	2	6	843167	843172	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	240047827
21125	NC_012806	TAAC	2	8	843178	843185	50 %	25 %	0 %	25 %	240047827
21126	NC_012806	AATA	2	8	843187	843194	75 %	25 %	0 %	0 %	240047827
21127	NC_012806	CAA	2	6	843221	843226	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	240047827
21128	NC_012806	TAA	2	6	843235	843240	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	240047827
21129	NC_012806	T	7	7	843241	843247	0 %	100 %	0 %	0 %	240047827
21130	NC_012806	T	6	6	843254	843259	0 %	100 %	0 %	0 %	240047827
21131	NC_012806	GTT	2	6	843330	843335	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	240047827
21132	NC_012806	T	6	6	843363	843368	0 %	100 %	0 %	0 %	240047827
21133	NC_012806	T	6	6	843372	843377	0 %	100 %	0 %	0 %	240047827
21134	NC_012806	A	7	7	843381	843387	100 %	0 %	0 %	0 %	240047827
21135	NC_012806	AT	3	6	843398	843403	50 %	50 %	0 %	0 %	240047827
21136	NC_012806	TTAAAT	2	12	843438	843449	50 %	50 %	0 %	0 %	240047827
21137	NC_012806	T	6	6	843461	843466	0 %	100 %	0 %	0 %	240047827
21138	NC_012806	TAC	2	6	843494	843499	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240047828
21139	NC_012806	TTC	2	6	843507	843512	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240047828
21140	NC_012806	TTC	2	6	843534	843539	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240047828
21141	NC_012806	TCT	2	6	843660	843665	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240047828
21142	NC_012806	GGT	2	6	843666	843671	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	240047828
21143	NC_012806	T	7	7	843674	843680	0 %	100 %	0 %	0 %	240047828
21144	NC_012806	T	7	7	843846	843852	0 %	100 %	0 %	0 %	240047829
21145	NC_012806	TCT	2	6	843862	843867	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240047829
21146	NC_012806	CCA	2	6	843954	843959	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	240047829
21147	NC_012806	ATT	2	6	843960	843965	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	240047829
21148	NC_012806	TGAAG	2	10	843975	843984	40 %	20 %	40 %	0 %	240047829
21149	NC_012806	ACT	2	6	843993	843998	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240047829
21150	NC_012806	GTT	2	6	844042	844047	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	240047829
21151	NC_012806	T	6	6	844046	844051	0 %	100 %	0 %	0 %	240047829
21152	NC_012806	TAA	2	6	844075	844080	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	240047829
21153	NC_012806	T	7	7	844090	844096	0 %	100 %	0 %	0 %	240047829
21154	NC_012806	TTG	2	6	844121	844126	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	240047829
21155	NC_012806	TG	3	6	844134	844139	0 %	50 %	50 %	0 %	240047829
21156	NC_012806	ACA	2	6	844140	844145	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	240047829
21157	NC_012806	TTG	2	6	844190	844195	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	240047829
21158	NC_012806	GAA	2	6	844258	844263	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240047829
21159	NC_012806	GTA	2	6	844290	844295	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240047829
21160	NC_012806	ATT	2	6	844331	844336	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	240047829
21161	NC_012806	TTG	2	6	844373	844378	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	240047829
21162	NC_012806	T	7	7	844389	844395	0 %	100 %	0 %	0 %	240047829
21163	NC_012806	T	6	6	844427	844432	0 %	100 %	0 %	0 %	240047829
21164	NC_012806	AAAT	2	8	844483	844490	75 %	25 %	0 %	0 %	240047829
21165	NC_012806	ACA	2	6	844509	844514	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	240047829
21166	NC_012806	CAA	2	6	844519	844524	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	240047829
21167	NC_012806	AAT	2	6	844586	844591	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	240047829
21168	NC_012806	TTGT	2	8	844693	844700	0 %	75 %	25 %	0 %	240047829
21169	NC_012806	TGTA	2	8	844723	844730	25 %	50 %	25 %	0 %	240047829
21170	NC_012806	TAT	2	6	844735	844740	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	240047829
21171	NC_012806	TAA	2	6	844775	844780	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	240047829
21172	NC_012806	ATTA	2	8	844862	844869	50 %	50 %	0 %	0 %	240047829
21173	NC_012806	GGT	2	6	844971	844976	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	240047829
21174	NC_012806	TAT	2	6	844981	844986	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	240047829
21175	NC_012806	TAT	2	6	845035	845040	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	240047829
21176	NC_012806	TAGT	2	8	845044	845051	25 %	50 %	25 %	0 %	240047829
21177	NC_012806	AAT	2	6	845067	845072	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	240047829
21178	NC_012806	TA	3	6	845156	845161	50 %	50 %	0 %	0 %	240047829
21179	NC_012806	CTG	2	6	845170	845175	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240047829
21180	NC_012806	A	6	6	845180	845185	100 %	0 %	0 %	0 %	240047829
21181	NC_012806	ATT	2	6	845195	845200	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	240047829
21182	NC_012806	CAC	2	6	845206	845211	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	240047829
21183	NC_012806	TTTTCA	2	12	845229	845240	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	240047829
21184	NC_012806	AAT	2	6	845243	845248	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	240047829
21185	NC_012806	ATT	2	6	845288	845293	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	240047829
21186	NC_012806	T	6	6	845303	845308	0 %	100 %	0 %	0 %	240047829
21187	NC_012806	TAT	3	9	845341	845349	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	240047829
21188	NC_012806	A	6	6	845361	845366	100 %	0 %	0 %	0 %	240047829
21189	NC_012806	GTT	3	9	845379	845387	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	240047829
21190	NC_012806	CTAA	2	8	845388	845395	50 %	25 %	0 %	25 %	240047829
21191	NC_012806	GGTT	2	8	845404	845411	0 %	50 %	50 %	0 %	240047829
21192	NC_012806	T	6	6	845417	845422	0 %	100 %	0 %	0 %	240047829
21193	NC_012806	AAC	2	6	845501	845506	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	240047829
21194	NC_012806	TGAA	2	8	845533	845540	50 %	25 %	25 %	0 %	240047829
21195	NC_012806	A	6	6	845539	845544	100 %	0 %	0 %	0 %	240047829
21196	NC_012806	T	7	7	845602	845608	0 %	100 %	0 %	0 %	240047829
21197	NC_012806	A	6	6	845633	845638	100 %	0 %	0 %	0 %	240047829

< Previous12...31323334353637383940414243Next >

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.